隨著第二代單細(xì)胞測序技術(shù)和第三代測序技術(shù)的快速發(fā)展，生物研究領(lǐng)域發(fā)生了巨大的變化。在過去，想要從大量細(xì)胞中獲得足夠多的細(xì)胞DNA進(jìn)行測序，因此測序的結(jié)果是這些細(xì)胞“整體”的表征；然而，由于細(xì)胞的異質(zhì)性，同一表型細(xì)胞的遺傳信息可能會存在差異，許多低豐度信息將在整體表征中丟失；而單細(xì)胞測序技術(shù)的應(yīng)運(yùn)而生，解決了傳統(tǒng)高通量測序帶來的的局限性。

　　單細(xì)胞懸液測序技術(shù)是指對在單個細(xì)胞上，對基因組、轉(zhuǎn)錄組、表觀組進(jìn)行的高通量測序分析的新技術(shù)。它可揭示單個細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài)，反映細(xì)胞之間的異質(zhì)性，在腫瘤、發(fā)育生物學(xué)、微生物學(xué)、神經(jīng)科學(xué)等行業(yè)領(lǐng)域發(fā)揮了重要作用。

　　單細(xì)胞測序技術(shù)的應(yīng)用

　　1、應(yīng)用于腫瘤研究

　　深圳華大基因研究所在腫瘤研究方面取得了突破性進(jìn)展，并在國際著名學(xué)術(shù)期刊《細(xì)胞》上發(fā)表了研究論文。這項工作開發(fā)了一種解析單細(xì)胞基因組的新方法，并將其應(yīng)用于腫瘤內(nèi)部遺傳特征的研究，研究原發(fā)性血小板增多癥和腎透明細(xì)胞癌；這種新方法解決了以前無法解決的高腫瘤異質(zhì)性問題，為深入研究癌癥的發(fā)生、發(fā)展機(jī)制和診斷提供了新的研究思路和研究方向。

　　研究人員在單細(xì)胞水平上分析了腦瘤的基因組，并在人腦瘤樣本中確定了癌癥干細(xì)胞及其分化后代。研究人員分析了6個早期少突膠質(zhì)細(xì)胞樣本的4000多個腫瘤細(xì)胞，發(fā)現(xiàn)腫瘤細(xì)胞可分為三類。其中一個更像神經(jīng)干細(xì)胞，另外兩個有一定的分化特征。結(jié)果表明，癌癥干細(xì)胞是少突膠質(zhì)細(xì)胞瘤的主要生長來源，這些細(xì)胞將成為有前途的治療目標(biāo)。

　　2、應(yīng)用于微生物的研究

　　在微生物領(lǐng)域，單細(xì)胞測序也取得了重大突破。2017年，來自美國的2017年UCSF原核生物實現(xiàn)了微生物單細(xì)胞懸液測序技術(shù)。